151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1850 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0864  HAD family hydrolase  38.7 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  34.17 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4324  trehalose-phosphatase  33.19 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.0213832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  31.14 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.98 
 
 		 745 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  33.75 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  34.04 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  31.63 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 1186 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  34.6 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  33.61 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3989  HAD family hydrolase  33.71 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  25.68 
 
 		 738 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0179  HAD family hydrolase  31.23 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183714  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1803  HAD family hydrolase  28 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0790667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  34.33 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  32.73 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0794  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.73 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  32.08 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  30.81 
 
 		 744 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  33 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  36 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.1 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43599  predicted protein  28.9 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal  0.825443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  31.37 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.61 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  27.98 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.8 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 867 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  30.99 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.19 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  32.72 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  29.52 
 
 		 867 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  37.59 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  30.54 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  30.35 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1363  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.26 
 
 		 751 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.475191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  30.54 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0598  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  27.27 
 
 		 735 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.289814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  30.22 
 
 		 391 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  29.63 
 
 		 842 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  30.19 
 
 		 417 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.57 
 
 		 1314 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  31.56 
 
 		 867 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2336  trehalose-phosphatase  31.41 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.922913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  31.73 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.68 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  30.05 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  30.69 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  30.05 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.08 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.2 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1903  trehalose-phosphatase  33.58 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.149485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  29.15 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  35.98 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  25.73 
 
 		 733 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  31.63 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  29.35 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  29.15 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 1225 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.13 
 
 		 525 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  33.95 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  28.65 
 
 		 731 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  29.41 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  30.45 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0675  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.49 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.418374  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  34.09 
 
 		 844 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  30.58 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1968  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 788 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>