161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3989 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3989  HAD family hydrolase  100 
 
 		 281 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  51.72 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  45.09 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0794  trehalose-phosphatase  48.68 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  44.32 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  44.27 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  44.81 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0179  HAD family hydrolase  44.66 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183714  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  30.74 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0099  HAD family hydrolase  36.67 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2971  HAD family hydrolase  37.2 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5832  trehalose-phosphatase  33.09 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  28.74 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0864  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  32.07 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.09 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  34.25 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  30.33 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 1186 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  33.05 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  34.09 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  33.79 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.79 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.67 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.02 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0296  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.8 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  33.48 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  35.92 
 
 		 867 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.62 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0675  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.41 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.418374  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.23 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.62 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.2 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.17 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.2 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  30.95 
 
 		 744 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  33.64 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.18 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  32.86 
 
 		 842 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  31.09 
 
 		 1225 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  34.26 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.2 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  32.41 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.58 
 
 		 733 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  32.54 
 
 		 847 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  29.09 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  29.33 
 
 		 867 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  30.99 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31 
 
 		 737 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4324  trehalose-phosphatase  29.48 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.0213832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.26 
 
 		 737 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  30.51 
 
 		 1327 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  32.22 
 
 		 723 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0450  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.42 
 
 		 723 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.8 
 
 		 723 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0598  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.57 
 
 		 735 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.289814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.91 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1808  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.27 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2336  trehalose-phosphatase  30.81 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.922913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  25.76 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0751  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.18 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  31.44 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  32.02 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  29.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  26.29 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  32.37 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  30.04 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  31.95 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  31.11 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  31.11 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.16 
 
 		 1314 aa  55.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  31.88 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  31.88 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>