189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0060 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  100 
 
 
238 aa  464  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  44.74 
 
 
238 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  42.79 
 
 
229 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  38.4 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  40.71 
 
 
256 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  38.1 
 
 
269 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  38.7 
 
 
257 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.66 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  38.14 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  39.66 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  37.66 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  37.66 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  35.25 
 
 
249 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  41.48 
 
 
272 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  38.36 
 
 
250 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.56 
 
 
1314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  37.66 
 
 
253 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  37.93 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  38.86 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  34.96 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  38.72 
 
 
744 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  39.67 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  38.16 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  37.39 
 
 
250 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
243 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  38.16 
 
 
269 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  38.16 
 
 
243 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  37.39 
 
 
269 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.93 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.9 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  35 
 
 
258 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  37.96 
 
 
261 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  37.39 
 
 
269 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.06 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  38.55 
 
 
248 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  35.06 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  36.4 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  36.97 
 
 
269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  36.97 
 
 
269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  34.92 
 
 
1186 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.32 
 
 
267 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  33.93 
 
 
259 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.32 
 
 
267 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.32 
 
 
267 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.8 
 
 
257 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.32 
 
 
267 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  37.86 
 
 
417 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.24 
 
 
267 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  37.77 
 
 
253 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  40.44 
 
 
867 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  39.21 
 
 
256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  39.21 
 
 
256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  39.21 
 
 
256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  36.91 
 
 
260 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  35.27 
 
 
249 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  34.73 
 
 
294 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  39.56 
 
 
867 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  39.46 
 
 
265 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  34.02 
 
 
277 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  38.12 
 
 
253 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  36.6 
 
 
278 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.52 
 
 
525 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.18 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1803  HAD family hydrolase  28.4 
 
 
293 aa  99  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0790667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0807  trehalose-phosphatase  36.96 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.19 
 
 
265 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.9 
 
 
266 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.9 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  34.43 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  33.79 
 
 
261 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  30.9 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  37.13 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  36.12 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  36.96 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.68 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  35.68 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  38.7 
 
 
842 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.68 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  38.27 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0179  HAD family hydrolase  37.4 
 
 
295 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183714  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  35.68 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.68 
 
 
737 aa  95.9  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  33.2 
 
 
269 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  32.78 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  35.39 
 
 
731 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.59 
 
 
737 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  38.1 
 
 
847 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  38.16 
 
 
844 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  35.83 
 
 
282 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>