184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2064 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  43.12 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0675  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.94 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.418374  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0795  trehalose-phosphatase  43.02 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  41.5 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  41.34 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2949  trehalose-phosphatase  43.09 
 
 		 775 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.75 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  40.5 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  36.86 
 
 		 744 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  38.58 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  38.58 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  38.58 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  36.8 
 
 		 842 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0751  HAD family hydrolase  39.84 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.16 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  36 
 
 		 867 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  34.9 
 
 		 847 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19360  trehalose-phosphatase  38.98 
 
 		 761 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.752933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  37.35 
 
 		 867 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5011  trehalose-phosphatase  39.68 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  36.95 
 
 		 867 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0807  trehalose-phosphatase  36.47 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  36.36 
 
 		 844 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  35.71 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  33.76 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  34.11 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  34.92 
 
 		 876 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.95 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.95 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  32.56 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  31.85 
 
 		 893 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.64 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.64 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  34.98 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.25 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.33 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.25 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  30.86 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  36.1 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  32.5 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.74 
 
 		 745 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  31.85 
 
 		 1225 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  37.13 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  33.04 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  30.13 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  30.3 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  29.18 
 
 		 738 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  32.08 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  27.85 
 
 		 733 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.4 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  30.45 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  28.85 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  32.77 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.61 
 
 		 737 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  34.21 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  34.18 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  32.9 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.71 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  36.92 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.76 
 
 		 733 aa  79  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  31.87 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.74 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  31.45 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  31.8 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0794  trehalose-phosphatase  34.02 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.68 
 
 		 1314 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  26.23 
 
 		 731 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  32.46 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  31.03 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  32.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  32.31 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  33.33 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  30.38 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  33.33 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  34.2 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1968  trehalose-phosphatase  29.96 
 
 		 788 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  32.88 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  32.88 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>