174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3613 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  85.13 
 
 		 269 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  66.03 
 
 		 265 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  65.67 
 
 		 269 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  65.04 
 
 		 268 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  70.61 
 
 		 277 aa  339  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  69.83 
 
 		 278 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  41 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  41.35 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  40.74 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  40.08 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  40.25 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.31 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.86 
 
 		 268 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  41.95 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  39.34 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  40.69 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  37.5 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  38.52 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  37.39 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  38.52 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  38.93 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  38.93 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  38.11 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  38.11 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  38.52 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.03 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 245 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.24 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.61 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  38.52 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.63 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  37.14 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  37.14 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.61 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  40.27 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  39.66 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.18 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  40.87 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  37.55 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  38.5 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  38.5 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  37.39 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  41.23 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  40.76 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  39.44 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.97 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.29 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  40.28 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.61 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.8 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  37.18 
 
 		 251 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.18 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.23 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  34.23 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.33 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.2 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  36.1 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  39.83 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  36.93 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  38.34 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  35.17 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0866  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  33.73 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  35.89 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  38.39 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  35.46 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  33.05 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  40.77 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  34.63 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  36.03 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1803  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0790667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  32.62 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  29.96 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.05 
 
 		 723 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0450  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  33.8 
 
 		 723 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  34.74 
 
 		 723 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 1186 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1808  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.7 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  32.67 
 
 		 731 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  27.5 
 
 		 733 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  28.19 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>