184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0987 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  58.61 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  55.93 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  52.97 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  53.39 
 
 		 245 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  54.08 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  54.08 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  54.08 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  54.08 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  53.65 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  53.65 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  51.56 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  52.59 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  52.59 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  52.94 
 
 		 269 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  49.78 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  49.78 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  48.48 
 
 		 249 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  51.2 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  51.45 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  50.8 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  50.2 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  50.41 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  54.08 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  49.8 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  49.8 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  50 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  51.03 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  47.64 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.52 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.42 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.45 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.45 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  47.86 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.45 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.45 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.51 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.66 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.66 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  46.49 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  44.87 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  43.97 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.13 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.95 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.86 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  45.73 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.93 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  42.92 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  44.64 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  45.3 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  42.79 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  41.49 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  44.08 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  40.25 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  45.85 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  41.08 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  44.49 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  42.17 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  45.06 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  41.03 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.33 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  41.05 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.92 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.74 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  42.72 
 
 		 265 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  41.49 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.49 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  40.51 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  43.23 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  41.89 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.03 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0866  HAD family hydrolase  39.42 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  39.04 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  40.52 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  37.19 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  40.17 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  39.52 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  43.05 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  35.22 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1803  HAD family hydrolase  33.06 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0790667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  39.48 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0450  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  38.01 
 
 		 723 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  35.22 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  38.05 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  38.29 
 
 		 723 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  37.84 
 
 		 723 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  36.6 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.82 
 
 		 1314 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 1186 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.73 
 
 		 737 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.34 
 
 		 737 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3011  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.74 
 
 		 724 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.810298 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>