More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4989 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  53.62 
 
 
804 aa  779    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.47 
 
 
1314 aa  1013    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  41.41 
 
 
1053 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  40.66 
 
 
1055 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  60.61 
 
 
1327 aa  1276    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.25 
 
 
1088 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.95 
 
 
1051 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  56.81 
 
 
1215 aa  1323    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  50.9 
 
 
713 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.64 
 
 
1053 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  52.39 
 
 
794 aa  789    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.9 
 
 
1051 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  100 
 
 
1186 aa  2383    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  46.65 
 
 
807 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  56.81 
 
 
1215 aa  1323    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  57.25 
 
 
1225 aa  1321    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  51.21 
 
 
788 aa  754    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  52.84 
 
 
807 aa  799    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  49.56 
 
 
807 aa  761    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  56.81 
 
 
1215 aa  1323    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.05 
 
 
1053 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.3 
 
 
1052 aa  630  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.85 
 
 
1050 aa  632  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.57 
 
 
1125 aa  596  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  35.48 
 
 
904 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  38.77 
 
 
806 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  34.95 
 
 
769 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  52.06 
 
 
391 aa  357  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  29.67 
 
 
775 aa  335  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  30.25 
 
 
755 aa  332  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  29.77 
 
 
780 aa  329  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.81 
 
 
978 aa  328  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  28.61 
 
 
763 aa  320  9e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  30.18 
 
 
748 aa  317  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 
759 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  28.94 
 
 
965 aa  304  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  31.27 
 
 
807 aa  299  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.43 
 
 
789 aa  295  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  28.04 
 
 
769 aa  288  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  29.37 
 
 
787 aa  288  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.01 
 
 
781 aa  281  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.82 
 
 
720 aa  277  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  27.11 
 
 
778 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.01 
 
 
794 aa  271  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  27.16 
 
 
787 aa  270  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  31.27 
 
 
760 aa  266  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  25.77 
 
 
780 aa  262  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.79 
 
 
759 aa  260  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.08 
 
 
762 aa  253  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.43 
 
 
777 aa  252  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  26.12 
 
 
781 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  29.86 
 
 
795 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  27.15 
 
 
752 aa  237  8e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  29.73 
 
 
795 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  27.96 
 
 
757 aa  232  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.12 
 
 
749 aa  231  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.12 
 
 
761 aa  229  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  28 
 
 
761 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  28.45 
 
 
858 aa  228  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  29.59 
 
 
704 aa  227  8e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3525  trehalose 6-phosphate phosphorylase  39.11 
 
 
450 aa  227  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125105  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  25.09 
 
 
774 aa  225  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  28.05 
 
 
790 aa  224  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  27.92 
 
 
790 aa  222  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  25.57 
 
 
780 aa  222  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.06 
 
 
755 aa  221  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.7 
 
 
755 aa  220  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.7 
 
 
755 aa  220  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.7 
 
 
755 aa  220  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  28.96 
 
 
795 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  27.83 
 
 
755 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  27.83 
 
 
755 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
346 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  25.94 
 
 
825 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.39 
 
 
755 aa  213  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  29.61 
 
 
780 aa  212  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  28.37 
 
 
800 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.81 
 
 
843 aa  209  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  26.98 
 
 
755 aa  208  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  27.37 
 
 
834 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  25.12 
 
 
752 aa  207  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  25.46 
 
 
778 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  25 
 
 
771 aa  204  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  25.42 
 
 
710 aa  203  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  24.81 
 
 
758 aa  202  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  36.96 
 
 
417 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  26.39 
 
 
776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.62 
 
 
810 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  24.58 
 
 
788 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  25.79 
 
 
789 aa  198  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.7 
 
 
778 aa  197  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.88 
 
 
787 aa  197  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  25.6 
 
 
748 aa  195  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  42.26 
 
 
271 aa  195  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  23.49 
 
 
750 aa  194  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.63 
 
 
525 aa  194  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.91 
 
 
786 aa  194  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  27.48 
 
 
789 aa  193  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  25.47 
 
 
767 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>