127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2162 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  53.93 
 
 
804 aa  796    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  58.67 
 
 
1314 aa  969    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.18 
 
 
1053 aa  686    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  44.98 
 
 
1055 aa  689    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  56.86 
 
 
1088 aa  941    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  53.64 
 
 
788 aa  791    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  55.05 
 
 
1215 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  54.85 
 
 
713 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  52.99 
 
 
807 aa  805    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.6 
 
 
1053 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.43 
 
 
1051 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  56.41 
 
 
794 aa  840    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  55.05 
 
 
1215 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  55.24 
 
 
1225 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  100 
 
 
807 aa  1645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  57.29 
 
 
807 aa  912    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  55.05 
 
 
1215 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  52.84 
 
 
1186 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  51.45 
 
 
1327 aa  775    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.43 
 
 
1053 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.69 
 
 
1051 aa  700    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.39 
 
 
1050 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.63 
 
 
1052 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.44 
 
 
1125 aa  658    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  39.22 
 
 
904 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  38.37 
 
 
806 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  33.54 
 
 
769 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  30 
 
 
780 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  31.66 
 
 
755 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
759 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  29.38 
 
 
775 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  30.38 
 
 
748 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  31.86 
 
 
787 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  28.79 
 
 
763 aa  338  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  29.92 
 
 
778 aa  329  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
978 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.36 
 
 
965 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  31.03 
 
 
807 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  31.24 
 
 
781 aa  314  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.88 
 
 
789 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  32.6 
 
 
720 aa  303  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  29.47 
 
 
787 aa  299  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  28.27 
 
 
781 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  30.92 
 
 
794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.42 
 
 
759 aa  281  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  26.98 
 
 
780 aa  278  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  27.86 
 
 
769 aa  275  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.17 
 
 
778 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  27.08 
 
 
774 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  30.07 
 
 
790 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.14 
 
 
757 aa  259  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  28.39 
 
 
790 aa  256  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  29.57 
 
 
776 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  29.59 
 
 
795 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  29.42 
 
 
795 aa  246  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  28.38 
 
 
755 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  28.62 
 
 
795 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  28.38 
 
 
755 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  26.23 
 
 
780 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3525  trehalose 6-phosphate phosphorylase  41.86 
 
 
450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125105  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  28.38 
 
 
755 aa  245  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  28.38 
 
 
755 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  30.08 
 
 
760 aa  245  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.64 
 
 
777 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.25 
 
 
755 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 
755 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  28.25 
 
 
755 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  25.81 
 
 
748 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.04 
 
 
762 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.64 
 
 
771 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  26.29 
 
 
753 aa  237  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  27.73 
 
 
755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  25.44 
 
 
788 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  25.43 
 
 
805 aa  232  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  29.36 
 
 
704 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.19 
 
 
825 aa  230  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  25.06 
 
 
767 aa  230  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  32.25 
 
 
761 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  32.05 
 
 
761 aa  230  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.01 
 
 
749 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  27.82 
 
 
858 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.48 
 
 
778 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  25.38 
 
 
789 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  24.33 
 
 
756 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  25.59 
 
 
710 aa  217  9e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  24.55 
 
 
768 aa  214  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  25.36 
 
 
752 aa  214  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  24.28 
 
 
765 aa  211  6e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.27 
 
 
787 aa  207  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.9 
 
 
786 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  26.64 
 
 
834 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  27.09 
 
 
780 aa  206  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  25.91 
 
 
843 aa  204  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  25.06 
 
 
752 aa  203  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  28.04 
 
 
800 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  25.75 
 
 
767 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  27.1 
 
 
784 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 
804 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.41 
 
 
807 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  28.35 
 
 
784 aa  190  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>