127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1874 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
753 aa  1564    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  52.83 
 
 
748 aa  828    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  42.46 
 
 
776 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  35.9 
 
 
769 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  32.37 
 
 
748 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
759 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  32.5 
 
 
965 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  32.53 
 
 
978 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  31.05 
 
 
780 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  32.57 
 
 
775 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  32.48 
 
 
755 aa  363  9e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  31.69 
 
 
720 aa  346  8.999999999999999e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.73 
 
 
759 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  31.43 
 
 
763 aa  339  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  32.76 
 
 
787 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  31.65 
 
 
787 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  30.93 
 
 
794 aa  321  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  29.65 
 
 
780 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  31.22 
 
 
789 aa  318  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  30.73 
 
 
807 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.31 
 
 
757 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  27.61 
 
 
755 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.7 
 
 
755 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  27.61 
 
 
755 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.7 
 
 
755 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  27.61 
 
 
755 aa  310  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.97 
 
 
755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.7 
 
 
755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.42 
 
 
781 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  27.61 
 
 
755 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  30.04 
 
 
781 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.49 
 
 
749 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  29.18 
 
 
760 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  28.1 
 
 
765 aa  277  4e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  28.25 
 
 
790 aa  277  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  27.98 
 
 
790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  27.35 
 
 
778 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.54 
 
 
1053 aa  275  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  28.99 
 
 
780 aa  273  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.4 
 
 
1051 aa  270  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.56 
 
 
777 aa  266  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.12 
 
 
1050 aa  265  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.64 
 
 
1053 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  32.88 
 
 
762 aa  263  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 
761 aa  257  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 
761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  25.95 
 
 
795 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  25.82 
 
 
795 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  25.35 
 
 
858 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  25.99 
 
 
768 aa  248  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.64 
 
 
1052 aa  247  6e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  25.46 
 
 
795 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  25.19 
 
 
805 aa  246  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.47 
 
 
1055 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.63 
 
 
1051 aa  245  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  26.39 
 
 
750 aa  243  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  28.74 
 
 
788 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  26.59 
 
 
791 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  26.61 
 
 
752 aa  239  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.65 
 
 
825 aa  237  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  25.98 
 
 
807 aa  237  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  26.79 
 
 
784 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  26.87 
 
 
789 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  26.33 
 
 
791 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  25.77 
 
 
767 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.97 
 
 
778 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  27.55 
 
 
710 aa  231  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  26.54 
 
 
752 aa  230  9e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  25.2 
 
 
794 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  26.2 
 
 
834 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.61 
 
 
807 aa  228  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  27 
 
 
704 aa  227  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  26.63 
 
 
784 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.32 
 
 
786 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  25.6 
 
 
774 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.7 
 
 
904 aa  224  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  24.94 
 
 
848 aa  223  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.75 
 
 
786 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.29 
 
 
807 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
804 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  24.84 
 
 
789 aa  220  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  24.9 
 
 
800 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  24.17 
 
 
843 aa  217  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.65 
 
 
782 aa  217  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.52 
 
 
778 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.79 
 
 
787 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  25.1 
 
 
771 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.68 
 
 
810 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.56 
 
 
1088 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  23.84 
 
 
780 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  26.13 
 
 
769 aa  212  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.08 
 
 
1314 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  25.32 
 
 
824 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.47 
 
 
788 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  23.65 
 
 
790 aa  208  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  24.23 
 
 
758 aa  207  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  24.97 
 
 
787 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  24.97 
 
 
787 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  24.97 
 
 
787 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  25 
 
 
786 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>