125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3314 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 		 805 aa  1683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  34.47 
 
 		 774 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  33.71 
 
 		 778 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  33.87 
 
 		 780 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  32.58 
 
 		 781 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  33.62 
 
 		 771 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.12 
 
 		 778 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  33.8 
 
 		 767 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  32.04 
 
 		 750 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  34.82 
 
 		 710 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  32.05 
 
 		 765 aa  413  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  32.2 
 
 		 768 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  31.12 
 
 		 758 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  30.67 
 
 		 780 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  29.83 
 
 		 751 aa  382  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  30.52 
 
 		 752 aa  379  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  29.34 
 
 		 752 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  28.69 
 
 		 858 aa  357  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  29.7 
 
 		 775 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  26.89 
 
 		 795 aa  351  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.59 
 
 		 807 aa  350  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  27.42 
 
 		 824 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  27.37 
 
 		 790 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.84 
 
 		 786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.55 
 
 		 825 aa  336  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  27.27 
 
 		 784 aa  333  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.84 
 
 		 787 aa  327  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.89 
 
 		 786 aa  326  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  27.42 
 
 		 784 aa  323  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  27.15 
 
 		 834 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  27.38 
 
 		 800 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.59 
 
 		 843 aa  319  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.2 
 
 		 848 aa  319  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 		 794 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  28.69 
 
 		 755 aa  318  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 759 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 804 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  25.87 
 
 		 795 aa  313  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.89 
 
 		 810 aa  310  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  27.3 
 
 		 791 aa  310  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  26.88 
 
 		 791 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  25.75 
 
 		 795 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  27.35 
 
 		 789 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  34.77 
 
 		 790 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  26.56 
 
 		 780 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  26.18 
 
 		 778 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  27.05 
 
 		 769 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  27.85 
 
 		 748 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  31.65 
 
 		 780 aa  297  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  25.37 
 
 		 767 aa  295  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  27.41 
 
 		 789 aa  294  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  26.78 
 
 		 786 aa  294  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.28 
 
 		 759 aa  294  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  33.48 
 
 		 788 aa  293  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.06 
 
 		 777 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  26.07 
 
 		 720 aa  290  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  26.44 
 
 		 794 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  29.32 
 
 		 787 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 978 aa  286  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  27.27 
 
 		 781 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  33.26 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  28.26 
 
 		 807 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.62 
 
 		 749 aa  283  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  27.43 
 
 		 787 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  25.94 
 
 		 790 aa  280  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  26.17 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  26.17 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  30.1 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  26.56 
 
 		 786 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.46 
 
 		 777 aa  257  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.78 
 
 		 1050 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  24.77 
 
 		 755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  24.77 
 
 		 755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  32.28 
 
 		 781 aa  253  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  24.8 
 
 		 757 aa  252  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.98 
 
 		 762 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  31.42 
 
 		 789 aa  249  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.3 
 
 		 1052 aa  248  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  25.19 
 
 		 753 aa  246  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  25.42 
 
 		 748 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.82 
 
 		 1053 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  29.31 
 
 		 986 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  24.57 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  24.42 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.54 
 
 		 1051 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.98 
 
 		 1055 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.64 
 
 		 1051 aa  235  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.09 
 
 		 1053 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.89 
 
 		 782 aa  233  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.67 
 
 		 1314 aa  230  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.51 
 
 		 794 aa  230  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  29.66 
 
 		 965 aa  229  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.43 
 
 		 807 aa  218  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.07 
 
 		 1053 aa  217  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  23.22 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  23.59 
 
 		 807 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  28.6 
 
 		 755 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  28.6 
 
 		 755 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  28.6 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>