127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3313 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  52.83 
 
 		 753 aa  828    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 		 748 aa  1561    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  41.21 
 
 		 776 aa  588  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  35.58 
 
 		 769 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 		 759 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  31.46 
 
 		 748 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  30.63 
 
 		 763 aa  352  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  32.19 
 
 		 787 aa  348  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 978 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  31.42 
 
 		 775 aa  343  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  32.14 
 
 		 755 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  30.04 
 
 		 794 aa  336  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  29.05 
 
 		 780 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.45 
 
 		 965 aa  334  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  31.26 
 
 		 807 aa  333  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  30.44 
 
 		 781 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 		 789 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  31.77 
 
 		 787 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.18 
 
 		 759 aa  324  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  29.99 
 
 		 720 aa  323  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  30.21 
 
 		 755 aa  308  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  30.21 
 
 		 755 aa  308  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  30.07 
 
 		 755 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  30.07 
 
 		 755 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  30.07 
 
 		 755 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  30.07 
 
 		 755 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  30.64 
 
 		 755 aa  303  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  30.03 
 
 		 755 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  28.81 
 
 		 760 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  27.68 
 
 		 790 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.92 
 
 		 757 aa  285  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  28.12 
 
 		 780 aa  279  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  27.3 
 
 		 790 aa  279  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.82 
 
 		 762 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.94 
 
 		 777 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.31 
 
 		 749 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  28.07 
 
 		 781 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.88 
 
 		 1053 aa  262  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  27.44 
 
 		 795 aa  260  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  26.76 
 
 		 795 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.74 
 
 		 1051 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.45 
 
 		 1052 aa  257  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.23 
 
 		 1050 aa  256  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  27.02 
 
 		 795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.34 
 
 		 1053 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  33.26 
 
 		 761 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  32.91 
 
 		 761 aa  248  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.55 
 
 		 1055 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  27.21 
 
 		 778 aa  247  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.72 
 
 		 1051 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  25.42 
 
 		 805 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  28.85 
 
 		 704 aa  244  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.16 
 
 		 778 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  26.3 
 
 		 752 aa  234  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  26.15 
 
 		 750 aa  233  7.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.19 
 
 		 786 aa  233  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  26.88 
 
 		 752 aa  232  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  27.11 
 
 		 765 aa  226  8e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  25.38 
 
 		 807 aa  226  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  28.01 
 
 		 789 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  26.06 
 
 		 788 aa  224  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.81 
 
 		 807 aa  224  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  26.83 
 
 		 710 aa  222  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  24.67 
 
 		 774 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  23.92 
 
 		 858 aa  220  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 		 780 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  25.06 
 
 		 768 aa  219  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  25.8 
 
 		 767 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  24.9 
 
 		 758 aa  214  5.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  26.63 
 
 		 784 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  25.1 
 
 		 780 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  24.93 
 
 		 767 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.19 
 
 		 771 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  24.71 
 
 		 791 aa  208  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.88 
 
 		 787 aa  206  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  26.16 
 
 		 784 aa  206  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29 
 
 		 825 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  23.93 
 
 		 778 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  25 
 
 		 904 aa  204  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  26.54 
 
 		 756 aa  203  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.26 
 
 		 786 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  25.97 
 
 		 791 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  24.64 
 
 		 751 aa  202  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.86 
 
 		 713 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.89 
 
 		 1314 aa  201  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  24.14 
 
 		 794 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.94 
 
 		 788 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  23.47 
 
 		 843 aa  196  9e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 787 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.06 
 
 		 794 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  24.04 
 
 		 787 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  24.04 
 
 		 787 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  25.07 
 
 		 789 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  25 
 
 		 834 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  24.45 
 
 		 800 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.93 
 
 		 810 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.34 
 
 		 1088 aa  195  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  25.81 
 
 		 1327 aa  193  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  26.44 
 
 		 769 aa  192  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>