127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1550 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  68.79 
 
 		 781 aa  1151    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  71.58 
 
 		 787 aa  1201    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  67.71 
 
 		 787 aa  1115    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  64.62 
 
 		 807 aa  1050    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  62.04 
 
 		 794 aa  990    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 		 789 aa  1640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  40.76 
 
 		 755 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  39.36 
 
 		 775 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  37.92 
 
 		 763 aa  531  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  36.39 
 
 		 780 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  34.6 
 
 		 759 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  37.11 
 
 		 748 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  35.92 
 
 		 978 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  35.41 
 
 		 965 aa  419  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  33.67 
 
 		 760 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  32.63 
 
 		 778 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  35.14 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  30.94 
 
 		 780 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  33.24 
 
 		 776 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  33.33 
 
 		 761 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  33.06 
 
 		 761 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.12 
 
 		 762 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.55 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.6 
 
 		 759 aa  365  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  31.61 
 
 		 781 aa  364  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  30.27 
 
 		 780 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  31.91 
 
 		 769 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  30.46 
 
 		 755 aa  344  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  30.46 
 
 		 755 aa  344  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  30.49 
 
 		 755 aa  344  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  30.46 
 
 		 755 aa  343  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  30.46 
 
 		 755 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  30.46 
 
 		 755 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  30.18 
 
 		 755 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.25 
 
 		 1051 aa  337  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  29.49 
 
 		 755 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.4 
 
 		 1050 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.14 
 
 		 749 aa  334  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.37 
 
 		 757 aa  333  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 		 748 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.15 
 
 		 778 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  29.05 
 
 		 790 aa  328  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  28.86 
 
 		 790 aa  327  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  27.85 
 
 		 771 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.52 
 
 		 825 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  28.4 
 
 		 795 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.65 
 
 		 1053 aa  318  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  31.22 
 
 		 753 aa  318  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  29.44 
 
 		 858 aa  317  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  28.27 
 
 		 795 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.7 
 
 		 1053 aa  313  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.01 
 
 		 774 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  32.2 
 
 		 704 aa  310  5e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.25 
 
 		 1052 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.04 
 
 		 1051 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.41 
 
 		 1088 aa  300  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  28.46 
 
 		 834 aa  300  8e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.02 
 
 		 1055 aa  298  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  29.46 
 
 		 752 aa  295  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  27.41 
 
 		 805 aa  294  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  27.76 
 
 		 788 aa  292  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  27.02 
 
 		 768 aa  290  8e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  29.5 
 
 		 807 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  28.06 
 
 		 807 aa  289  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.67 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  25.88 
 
 		 789 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.83 
 
 		 843 aa  284  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.52 
 
 		 1314 aa  283  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  27.23 
 
 		 807 aa  283  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  29.2 
 
 		 752 aa  280  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  33.48 
 
 		 795 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  28.03 
 
 		 789 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  29.43 
 
 		 1186 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.01 
 
 		 848 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  29.41 
 
 		 710 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.92 
 
 		 788 aa  274  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.67 
 
 		 778 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 1215 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 1215 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 1215 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  27.53 
 
 		 794 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.23 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  27.4 
 
 		 780 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  25.65 
 
 		 767 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  27.43 
 
 		 758 aa  270  8.999999999999999e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  30.34 
 
 		 713 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  27.07 
 
 		 765 aa  266  1e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 804 aa  263  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.06 
 
 		 904 aa  263  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 1225 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  27.73 
 
 		 784 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  27.9 
 
 		 784 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.99 
 
 		 810 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  26.86 
 
 		 791 aa  259  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  27.21 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.32 
 
 		 787 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.78 
 
 		 786 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  26.24 
 
 		 791 aa  255  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  26.12 
 
 		 750 aa  254  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  26.3 
 
 		 800 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>