181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0306 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  100 
 
 
253 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  47.6 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  47.86 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  46.72 
 
 
249 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  45.71 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  45.02 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  46.94 
 
 
265 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  45.76 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  47.75 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  45.69 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  45.19 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  45.42 
 
 
272 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  40.87 
 
 
258 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  46.4 
 
 
250 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  46.09 
 
 
250 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  46.4 
 
 
250 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  45.34 
 
 
272 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  44.77 
 
 
269 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  45.65 
 
 
250 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  45.65 
 
 
250 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  43.78 
 
 
269 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  43.75 
 
 
245 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  44.21 
 
 
250 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  45.04 
 
 
260 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  43.37 
 
 
269 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  43.37 
 
 
269 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  46.44 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  46.09 
 
 
245 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.77 
 
 
267 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  40.33 
 
 
268 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  46.52 
 
 
250 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.81 
 
 
267 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.81 
 
 
267 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.81 
 
 
267 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  40.17 
 
 
243 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  40.17 
 
 
243 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.38 
 
 
267 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  42.49 
 
 
262 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  41.63 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.63 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  42.8 
 
 
260 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  41.25 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  42.37 
 
 
260 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  40.95 
 
 
257 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  41.42 
 
 
260 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.25 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  40.83 
 
 
266 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.9 
 
 
252 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.78 
 
 
252 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.67 
 
 
252 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  37.6 
 
 
261 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  42.36 
 
 
253 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  41.85 
 
 
254 aa  141  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  40 
 
 
265 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  39.39 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  40.42 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  39.65 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  39.51 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  42.03 
 
 
266 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.18 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  38.39 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  37.34 
 
 
251 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.86 
 
 
265 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.62 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.34 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  36.73 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  36.8 
 
 
269 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.39 
 
 
250 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  38.86 
 
 
268 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.44 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  37.26 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
262 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  36.97 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  35.56 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  37.66 
 
 
238 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  37.45 
 
 
247 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  36.8 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0866  HAD family hydrolase  36.45 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1803  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
293 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0790667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
260 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  39.82 
 
 
250 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  36.78 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  34.75 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  35.98 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.47 
 
 
525 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  35.87 
 
 
391 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  34.44 
 
 
737 aa  86.3  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 
744 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
1186 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03441  Trehalose-6-phosphate phosphatase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6Y289]  32.86 
 
 
908 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.714188  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1968  trehalose-phosphatase  33.19 
 
 
788 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  33.61 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  34.43 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>