186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0981 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  100 
 
 		 238 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  48.71 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  41 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  41 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.55 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  44.74 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  39.75 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  44.74 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  39.75 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  40.6 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  39.75 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  39.22 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  45 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  39.34 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  39.34 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.94 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.94 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.94 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.94 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  38.94 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  42.19 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  42.73 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  39.52 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.38 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  39.38 
 
 		 269 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.15 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  39.74 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  41.74 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  40.79 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  37.72 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  38.22 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.87 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  38.08 
 
 		 250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  37.29 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  39.48 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.2 
 
 		 525 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  38.39 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  36.91 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.08 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  37.08 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  36.96 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  37.05 
 
 		 737 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  37.13 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  39.81 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  36.8 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  32.27 
 
 		 745 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.87 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 1186 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  36.16 
 
 		 737 aa  105  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  38.22 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  38.67 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.39 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  38.22 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  37.78 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  36.89 
 
 		 731 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  32.91 
 
 		 738 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.89 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.9 
 
 		 733 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  37.13 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  34.47 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  34.63 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.47 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  35 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  35.71 
 
 		 417 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  37 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  37.96 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  33.93 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  32.03 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  35.02 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  35.62 
 
 		 847 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.66 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 278 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  38.56 
 
 		 265 aa  98.2  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.31 
 
 		 1314 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  38.1 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  37.02 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  35.25 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  35.68 
 
 		 277 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  34.2 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  36.03 
 
 		 842 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  35.27 
 
 		 744 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.11 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  38.57 
 
 		 867 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  38.57 
 
 		 867 aa  95.5  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4022  trehalose-phosphatase  34.32 
 
 		 724 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179404  normal  0.381996 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>