180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0919 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 259 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  45.35 
 
 		 744 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  43.24 
 
 		 867 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0795  trehalose-phosphatase  53.46 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  45.04 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  45.04 
 
 		 867 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  42.47 
 
 		 842 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  43.41 
 
 		 867 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  40.75 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  44.36 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  42.98 
 
 		 847 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  44.44 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  44.53 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  44.53 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  44.22 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  42.08 
 
 		 844 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0751  HAD family hydrolase  42.58 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19360  trehalose-phosphatase  40.53 
 
 		 761 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.752933  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  40.73 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0675  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.48 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.418374  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0807  trehalose-phosphatase  41.83 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.74 
 
 		 271 aa  121  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2949  trehalose-phosphatase  44.35 
 
 		 775 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  41.09 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5011  trehalose-phosphatase  42.35 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  37.96 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  38.42 
 
 		 876 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  31.75 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  37.61 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  32.91 
 
 		 1225 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  32.52 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  33.88 
 
 		 391 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  37.38 
 
 		 893 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  34.84 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.6 
 
 		 1314 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  34.69 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2549  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 1215 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 1215 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 1215 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  34.32 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  37.92 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  35.54 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.22 
 
 		 733 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1968  trehalose-phosphatase  31.87 
 
 		 788 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  32.14 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  34.04 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  26.97 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  31.97 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  30.29 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  32.23 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.44 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  36.44 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  35.92 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  33.47 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  33.96 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0598  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  32.95 
 
 		 735 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.289814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30 
 
 		 737 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.16 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.74 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  31.89 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.32 
 
 		 733 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.64 
 
 		 745 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.67 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 282 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  32.77 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  35 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.67 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  32.23 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  32.91 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  32.92 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  32.96 
 
 		 1327 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3304  trehalose-phosphatase  33.33 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  34.44 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  30.92 
 
 		 1186 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  34.06 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.63 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.08 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8924  trehalose-6-phosphatase  35.1 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.568468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.61 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  35.59 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1131  HAD family hydrolase  34.3 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.0112518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  30.89 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  33.07 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  30.65 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  32.03 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  32.03 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  34.53 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  31.42 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>