178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2549 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2549  HAD family hydrolase  100 
 
 		 297 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.38 
 
 		 525 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  40.67 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  41.87 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  40.58 
 
 		 1314 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  43.45 
 
 		 417 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  38.69 
 
 		 1225 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  38.65 
 
 		 391 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  41.95 
 
 		 1327 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  37.31 
 
 		 1215 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  37.31 
 
 		 1215 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  37.31 
 
 		 1215 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43599  predicted protein  35.71 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal  0.825443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 1186 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  37.55 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  37.65 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  38.43 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  36.89 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.16 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  35.16 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  35.15 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.07 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2971  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  34.87 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.89 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.05 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  33.58 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  31.42 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.51 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  36.16 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  32.66 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  35.37 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  35.27 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  30.2 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.83 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  30.4 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  35.04 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.97 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  31.34 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1131  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.0112518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  34.82 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.93 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03441  Trehalose-6-phosphate phosphatase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6Y289]  28.37 
 
 		 908 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.714188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.41 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  34.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0864  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  32.19 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  30.09 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5011  trehalose-phosphatase  36.76 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2216  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.65 
 
 		 752 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  30.86 
 
 		 744 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  30.12 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  30.12 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1808  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.38 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.25 
 
 		 733 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  33.19 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  33.19 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  33.05 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  34.75 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  33.06 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2336  trehalose-phosphatase  31.63 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.922913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  27.96 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  32.06 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.91 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  30.58 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  31.25 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  28.74 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  32.77 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2061  trehalose-phosphatase  34.82 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  30.42 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3270  trehalose-phosphatase  28.74 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  35.25 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  29.53 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  33.72 
 
 		 844 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  31.4 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  32.1 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  30.38 
 
 		 867 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19360  trehalose-phosphatase  29.01 
 
 		 761 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.752933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  32.18 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0296  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.54 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  33.08 
 
 		 842 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  32.74 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.42 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  31.14 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>