183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0807 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0807  trehalose-phosphatase  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  50.97 
 
 		 842 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  53.97 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  53.97 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  53.97 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  48.26 
 
 		 847 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  47.49 
 
 		 844 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  45.02 
 
 		 867 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  48.24 
 
 		 867 aa  208  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  52.44 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 867 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  47.28 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  51.6 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  42.02 
 
 		 744 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19360  trehalose-phosphatase  40.93 
 
 		 761 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.752933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.83 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.23 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  37.11 
 
 		 893 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5011  trehalose-phosphatase  41.77 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  40.74 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  36.47 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  35.55 
 
 		 876 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0751  HAD family hydrolase  40.39 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  38.96 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0675  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.73 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.418374  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0795  trehalose-phosphatase  43.13 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 238 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2949  trehalose-phosphatase  39.22 
 
 		 775 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  36.07 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  31.56 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  31.9 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  32.44 
 
 		 323 aa  92.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  32.23 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  30.26 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.38 
 
 		 733 aa  89.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.74 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  34.21 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.98 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  33.04 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.21 
 
 		 737 aa  86.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  33.04 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  31.71 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  32.63 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1363  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.6 
 
 		 751 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.475191 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.69 
 
 		 737 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  28.74 
 
 		 738 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  29.32 
 
 		 731 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 1215 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.49 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 1215 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.11 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 1215 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 1186 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.06 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  33.95 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  33.95 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.47 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.88 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  34.01 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.74 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  31.76 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  36.68 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  33.49 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1131  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.0112518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  33.76 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  34.06 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  33.49 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  32.75 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  25.49 
 
 		 745 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  33.02 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  30.74 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  31.14 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  33.05 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1903  trehalose-phosphatase  32.46 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.149485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  28.07 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  32.44 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.95 
 
 		 1314 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  32.44 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  32.56 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>