More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1813 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1813  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 425 aa  816    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  52.49 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  49.28 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  50.75 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  50.72 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  50.72 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  46.93 
 
 		 448 aa  309  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.57 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  51.12 
 
 		 435 aa  308  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38.88 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  48.92 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.88 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  47.78 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  44.73 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  49.39 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  46.72 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  51.97 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  47.29 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.71 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  49.14 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  47.92 
 
 		 438 aa  293  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.07 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 431 aa  292  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  50.36 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  37.47 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  48.64 
 
 		 437 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  37.47 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  46.67 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.45 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  48.52 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  49.5 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  47.41 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  47.39 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  45.85 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  36.75 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 		 433 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  47.25 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  47.96 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  48.51 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  48.01 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 431 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  41.73 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 438 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  38.63 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  47.02 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  42.32 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  47.23 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  34.83 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 440 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  37.32 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 438 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  47.82 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  37.04 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  37.33 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.96 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.96 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.42 
 
 		 442 aa  262  6.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>