More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0151 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
148 aa  293  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00378498  hitchhiker  0.00575994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4001  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.78 
 
 
144 aa  120  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0277  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.62 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0288  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.62 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.148779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0266  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.62 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  35.11 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  35.11 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.9 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0288  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.76 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.60438  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  32.39 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  36.43 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  36.17 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.17 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  36.17 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  36.43 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.88 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 
176 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  37.98 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  33.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.48 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  33.57 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  34.88 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  30.66 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.41 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  33.78 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  31.88 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  34.78 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.07 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  35.94 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  34.42 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  32.41 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  33.33 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  33.33 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  31.43 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  31.43 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  31.43 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  31.43 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.19 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.07 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  28.47 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.58 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  35.38 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  31.58 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  32.06 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  29.69 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  32.35 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  32.87 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  28.99 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  32.03 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  29.45 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  32.14 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  31.25 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.76 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  31.25 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  32.58 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  29.5 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
156 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.11 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>