60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0004 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  874    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  58.84 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  58.14 
 
 		 438 aa  501  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  30.19 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  36.93 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  37.13 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  37.13 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  33.43 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  36.61 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  27.66 
 
 		 399 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  28.98 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  28.21 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  28.66 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  28.66 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  31.56 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  27.82 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  27.82 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  23.42 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  24.04 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  24.04 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  24.04 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  24.04 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  24.04 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  29.13 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  26.84 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  23.98 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  23.92 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  23.76 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  22.84 
 
 		 483 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  22.84 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  22.84 
 
 		 483 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  22.84 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  22.84 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  22.84 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  22.84 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  25.44 
 
 		 484 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  27.93 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  25.55 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  24.3 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  21.43 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  25.68 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  20.87 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  22 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  21.52 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  18.94 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  23.91 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  22.44 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  23.62 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  31.62 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  25.91 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  26.11 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  23.02 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  22.96 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  27.47 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  24.29 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  24.68 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  28.12 
 
 		 323 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>