More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2079 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2079  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  260  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2069  hypothetical protein  98.41 
 
 
126 aa  256  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3601  transcriptional regulator, HxlR family protein  69.52 
 
 
111 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000065324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0860  HxlR family transcriptional regulator  65.09 
 
 
111 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0883  transcriptional regulator, HxlR family  65.09 
 
 
111 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3479  HxlR family transcriptional regulator  65.09 
 
 
111 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0823  transcriptional regulator  67.65 
 
 
114 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1497  HxlR family transcriptional regulator  63.27 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1364  hypothetical protein  68.89 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0896  HxlR family transcriptional regulator  69.84 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  34.31 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  34.31 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.51 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  34.65 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  39.76 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  37.04 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  35.8 
 
 
164 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  37.04 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  33.66 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  33.66 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  35.44 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  34.52 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  38.96 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2872  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.246022  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6637  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  35.23 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  34.12 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  31.03 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.84 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  31.58 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2130  transcriptional regulator, HxlR family  37.8 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.987634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35.63 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  31.31 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  31.31 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  31.31 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  31.31 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.65 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 
235 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0611  ArsR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  34.67 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>