53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1060 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  100 
 
 		 916 aa  1897    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  76.98 
 
 		 924 aa  1447    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  100 
 
 		 916 aa  1897    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  30.03 
 
 		 908 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  30.5 
 
 		 938 aa  396  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  29.3 
 
 		 917 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  30.17 
 
 		 913 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  30.09 
 
 		 973 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  29.42 
 
 		 913 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  28.54 
 
 		 954 aa  360  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  28.49 
 
 		 948 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  28.03 
 
 		 964 aa  360  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  28.46 
 
 		 954 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  28.35 
 
 		 952 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  28.15 
 
 		 955 aa  350  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  27.99 
 
 		 983 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  27.77 
 
 		 949 aa  346  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1002 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  29.11 
 
 		 960 aa  344  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  27.99 
 
 		 980 aa  343  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  27.35 
 
 		 941 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  28.41 
 
 		 960 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  27.97 
 
 		 962 aa  327  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  27.97 
 
 		 962 aa  327  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  28 
 
 		 889 aa  327  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  27.86 
 
 		 962 aa  325  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  27.59 
 
 		 978 aa  325  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  27.56 
 
 		 963 aa  323  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  27.56 
 
 		 956 aa  323  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  27.9 
 
 		 969 aa  323  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  27.82 
 
 		 955 aa  322  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1042 aa  319  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  27.56 
 
 		 963 aa  318  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  27.2 
 
 		 949 aa  317  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 659 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  32.37 
 
 		 240 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  21.02 
 
 		 809 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.17 
 
 		 868 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  22.17 
 
 		 855 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  22.17 
 
 		 855 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.35 
 
 		 847 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  22.27 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.45 
 
 		 845 aa  50.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  26.67 
 
 		 864 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.81 
 
 		 847 aa  47.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  20.62 
 
 		 866 aa  47  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  20.13 
 
 		 874 aa  47  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  21.52 
 
 		 827 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  24.71 
 
 		 843 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.27 
 
 		 866 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  26.21 
 
 		 815 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  25.34 
 
 		 836 aa  45.8  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  20.63 
 
 		 841 aa  44.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>