281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4106 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  44.05 
 
 		 822 aa  744    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.71 
 
 		 821 aa  743    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  99.64 
 
 		 832 aa  1706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  46.4 
 
 		 829 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  46.52 
 
 		 829 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  46.4 
 
 		 829 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  44.28 
 
 		 834 aa  750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  42.86 
 
 		 826 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  44.47 
 
 		 833 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  100 
 
 		 830 aa  1714    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  46.4 
 
 		 829 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.01 
 
 		 844 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.86 
 
 		 826 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.71 
 
 		 828 aa  725    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.52 
 
 		 832 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  44.71 
 
 		 812 aa  743    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  46.4 
 
 		 829 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  42.74 
 
 		 826 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  40.88 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.41 
 
 		 845 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.9 
 
 		 819 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  41.9 
 
 		 833 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  42.02 
 
 		 833 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  41.77 
 
 		 833 aa  631  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.38 
 
 		 835 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.2 
 
 		 818 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  39.05 
 
 		 816 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  41.16 
 
 		 792 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.5 
 
 		 846 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  38.76 
 
 		 885 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  38.64 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  38.76 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  38.52 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  38.25 
 
 		 882 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  38.05 
 
 		 881 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.93 
 
 		 881 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  37.97 
 
 		 880 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  38.1 
 
 		 860 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  37.93 
 
 		 881 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  37.85 
 
 		 880 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  38.62 
 
 		 881 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  38.74 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  38.62 
 
 		 881 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  38.74 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.17 
 
 		 828 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.29 
 
 		 828 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.11 
 
 		 828 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.29 
 
 		 828 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.35 
 
 		 817 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.84 
 
 		 828 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.85 
 
 		 829 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  35.6 
 
 		 813 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.72 
 
 		 813 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  35.56 
 
 		 813 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  35.56 
 
 		 813 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  40.3 
 
 		 579 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  31.84 
 
 		 820 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30 
 
 		 837 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.46 
 
 		 840 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.23 
 
 		 865 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  27.86 
 
 		 866 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  27.86 
 
 		 861 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  27.48 
 
 		 866 aa  302  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  30.44 
 
 		 850 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  30.44 
 
 		 833 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.31 
 
 		 833 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  30.31 
 
 		 833 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  26.96 
 
 		 888 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  26.58 
 
 		 866 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.74 
 
 		 851 aa  287  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.83 
 
 		 880 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  29 
 
 		 870 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  27.86 
 
 		 856 aa  283  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  26.91 
 
 		 866 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  28.76 
 
 		 870 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  28.47 
 
 		 839 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.05 
 
 		 876 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  28.88 
 
 		 870 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  27.04 
 
 		 863 aa  281  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  29.07 
 
 		 870 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  29.09 
 
 		 870 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.09 
 
 		 886 aa  280  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  26.81 
 
 		 866 aa  280  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  26.93 
 
 		 878 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  26.93 
 
 		 878 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.93 
 
 		 878 aa  279  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  26.81 
 
 		 878 aa  279  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  28.41 
 
 		 840 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.72 
 
 		 930 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.97 
 
 		 866 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  27.57 
 
 		 871 aa  273  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.99 
 
 		 853 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.83 
 
 		 850 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  27.5 
 
 		 848 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  27.59 
 
 		 848 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  27.59 
 
 		 848 aa  271  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  27.55 
 
 		 848 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.31 
 
 		 833 aa  270  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.66 
 
 		 844 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.4 
 
 		 867 aa  270  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>