More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0691 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  99.19 
 
 		 370 aa  738    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 370 aa  743    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  74.32 
 
 		 370 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  69.84 
 
 		 370 aa  504  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  53.03 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  51.1 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  51.1 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  47.86 
 
 		 354 aa  322  7e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  51.55 
 
 		 370 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  48.86 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  46.72 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  46.58 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  46.59 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  45.33 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  46.44 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  47.58 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  51.7 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  47.3 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  51 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  45.17 
 
 		 358 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  47.09 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  44.9 
 
 		 358 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 358 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  46.02 
 
 		 358 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  49.28 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  49.14 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 367 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  48.16 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  48.7 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  48.96 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  48.39 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  46.28 
 
 		 357 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  50.44 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  50.73 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  48.58 
 
 		 376 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  48.58 
 
 		 365 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 358 aa  291  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  48.68 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  48.58 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  52.04 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  48.88 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  46.72 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  46.89 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  47.15 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  45.17 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  46.2 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  48.59 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  49.02 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  47.86 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  47.72 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  52.38 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  46.36 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.75 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  47.08 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  46.74 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  47.18 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.76 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  51.09 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  47.01 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  47.25 
 
 		 368 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  45.92 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 369 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  44.77 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  48.82 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  46.3 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  46.72 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  46.67 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  48.07 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  46.94 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  48.68 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  42.94 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  46.35 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>