221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1361 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  383  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  98.94 
 
 
188 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  70.74 
 
 
188 aa  277  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  66.31 
 
 
188 aa  257  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  50.28 
 
 
192 aa  190  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  46.67 
 
 
188 aa  188  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  47.83 
 
 
186 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  46.45 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  44.26 
 
 
208 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  47.83 
 
 
186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  44.92 
 
 
187 aa  175  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  42.62 
 
 
198 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  44.57 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  40.87 
 
 
234 aa  170  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.75 
 
 
191 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  45.9 
 
 
185 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  45.95 
 
 
187 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  44.86 
 
 
187 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  44.86 
 
 
187 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  44.86 
 
 
187 aa  167  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  42.08 
 
 
203 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  43.96 
 
 
184 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  43.09 
 
 
191 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  41.27 
 
 
200 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  42.93 
 
 
186 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  42.47 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  44.86 
 
 
187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  46.81 
 
 
201 aa  164  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  47.09 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  44.32 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  44.32 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  41.94 
 
 
181 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  41.94 
 
 
194 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  43.55 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  41.8 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  46.7 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  41.94 
 
 
186 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  40.11 
 
 
189 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  47.13 
 
 
173 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  46.28 
 
 
189 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  45.86 
 
 
192 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  43.09 
 
 
211 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  43.09 
 
 
211 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  44.39 
 
 
193 aa  158  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  41.97 
 
 
200 aa  158  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  42.11 
 
 
189 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  43.96 
 
 
190 aa  157  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  41.18 
 
 
187 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  42.25 
 
 
187 aa  157  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  41.15 
 
 
199 aa  157  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  45.74 
 
 
189 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  45.05 
 
 
189 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  40.62 
 
 
199 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  39.56 
 
 
187 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  42.08 
 
 
193 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  42.62 
 
 
193 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  45.05 
 
 
189 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  42.78 
 
 
187 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  45.05 
 
 
189 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  40.11 
 
 
187 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  39.36 
 
 
195 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  39.01 
 
 
187 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  155  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  42.08 
 
 
190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  42.93 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  44.44 
 
 
216 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  41.8 
 
 
221 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  41.8 
 
 
192 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  42.7 
 
 
192 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  38.12 
 
 
188 aa  154  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  41.53 
 
 
190 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  42.7 
 
 
207 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  39.58 
 
 
199 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  39.58 
 
 
199 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>