More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2935 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
249 aa  477  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  60.53 
 
 
253 aa  238  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  54.44 
 
 
275 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  52.52 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  41.22 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  43.9 
 
 
242 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  38.34 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  41.94 
 
 
238 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  42.56 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  42.59 
 
 
241 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  40.7 
 
 
228 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40.2 
 
 
228 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.8 
 
 
232 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  40.57 
 
 
249 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  34.6 
 
 
239 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  41.14 
 
 
246 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  41.87 
 
 
255 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  48.19 
 
 
224 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 
240 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.82 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  38.61 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  39.41 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  36.59 
 
 
947 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  30.51 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.19 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.32 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  30.82 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  31.86 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  33.95 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.27 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.27 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  36.63 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  38.97 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.23 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  29.38 
 
 
233 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.54 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.32 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  36.95 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  30.26 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.43 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  36.93 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  45.19 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  29.12 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  29.12 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  43.21 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  32.63 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.06 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  36.57 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  37.62 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  30.82 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  36.75 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.99 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.43 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.27 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  37.7 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.39 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  27.82 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  36.46 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  38.71 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  34.25 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  38.1 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.76 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.17 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.23 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  37.11 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  38.04 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  28.89 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  37.2 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  30.14 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  32.7 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  34.78 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  30.14 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  32.04 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  39.6 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  31.16 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.99 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  32.67 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  30.14 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>