137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0401 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
537 aa  1055    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  64.5 
 
 
531 aa  661    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  64.69 
 
 
539 aa  673    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  69.39 
 
 
538 aa  696    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  54.48 
 
 
532 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  52.38 
 
 
540 aa  569  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  56.68 
 
 
546 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  50.57 
 
 
535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  50.09 
 
 
532 aa  549  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  50.38 
 
 
539 aa  545  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  52.47 
 
 
548 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  47.62 
 
 
530 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  32.61 
 
 
522 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25.41 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  24.2 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  23.3 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  22.81 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  23.15 
 
 
510 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  26.54 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  27.18 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  27.18 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  28.06 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  28.06 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  28.06 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  28.06 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  24.94 
 
 
494 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.5 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  27.11 
 
 
498 aa  68.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  27.09 
 
 
493 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.36 
 
 
500 aa  67  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  25.67 
 
 
506 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  26.86 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  26.86 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  22.1 
 
 
505 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  26.86 
 
 
493 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  27.81 
 
 
491 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  26.76 
 
 
494 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  28.06 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  28.06 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  28.06 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  26.33 
 
 
498 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  27.3 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  24.15 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.09 
 
 
515 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  23.19 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  26.86 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  27.46 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  25.41 
 
 
496 aa  57.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  25.34 
 
 
491 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  24.66 
 
 
504 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  29.83 
 
 
502 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  30 
 
 
496 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  28.64 
 
 
464 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  27.99 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  26.53 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  24.22 
 
 
498 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  25.42 
 
 
484 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4247  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.19 
 
 
492 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  26.44 
 
 
493 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  23.54 
 
 
498 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  22.47 
 
 
494 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  22.45 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  25.26 
 
 
505 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  25.08 
 
 
484 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  24.54 
 
 
483 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  20.86 
 
 
489 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.18 
 
 
518 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  28.81 
 
 
481 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  24.54 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  28.1 
 
 
492 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  25.21 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.17 
 
 
494 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  24.8 
 
 
511 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  28.29 
 
 
475 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  21.79 
 
 
509 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  26.67 
 
 
508 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  28.29 
 
 
475 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  28.29 
 
 
475 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  28.29 
 
 
475 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  24.92 
 
 
517 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  24.92 
 
 
517 aa  50.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  25.62 
 
 
526 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  27.05 
 
 
526 aa  50.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  25.6 
 
 
487 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  27.14 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  26.94 
 
 
484 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  27.14 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  28.73 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  27.83 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  27.36 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  28.57 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  27.36 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  23.81 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  26.6 
 
 
484 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.56 
 
 
496 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  26.42 
 
 
488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  26.42 
 
 
488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  25.18 
 
 
505 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.15 
 
 
499 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.08 
 
 
530 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>