48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0182 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  100 
 
 
593 aa  1182    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  59.28 
 
 
681 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  54.19 
 
 
578 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  49.23 
 
 
572 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  47.1 
 
 
589 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  31.4 
 
 
743 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  29.64 
 
 
545 aa  257  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  33.06 
 
 
572 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 
814 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 
502 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  34.94 
 
 
516 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  34.04 
 
 
451 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 
621 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  29.51 
 
 
475 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  28.69 
 
 
469 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  32.24 
 
 
584 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  31.13 
 
 
900 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  31.71 
 
 
566 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  30.8 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  28.7 
 
 
312 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 
343 aa  103  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
335 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  27.09 
 
 
332 aa  88.6  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  29.43 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  27.31 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  27.41 
 
 
673 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
332 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
493 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.07 
 
 
551 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 
847 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 
491 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 
377 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  25.33 
 
 
703 aa  47.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  26.14 
 
 
382 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  25.33 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  20.99 
 
 
673 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25.23 
 
 
365 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
468 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  30.16 
 
 
378 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 
556 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  24.14 
 
 
481 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  25.23 
 
 
483 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  22.54 
 
 
590 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  25.11 
 
 
456 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  31 
 
 
336 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  24.14 
 
 
333 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  23.49 
 
 
705 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  23.01 
 
 
376 aa  43.9  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>