More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3557 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
417 aa  868    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.58 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.38 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
445 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
415 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
415 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
418 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
397 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
539 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2863  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
409 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
346 aa  87  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.52 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
381 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.93 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25.82 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
733 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25.09 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
800 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  27.54 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.8 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  27.95 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  25 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  22.68 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.45 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  23.02 
 
 
401 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  23.52 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  37.04 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
750 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.16 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  31.46 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>