119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2824 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
361 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  43.96 
 
 
362 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  44.5 
 
 
373 aa  299  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  44.02 
 
 
371 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  45.11 
 
 
371 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  44.88 
 
 
362 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.14 
 
 
359 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  39.51 
 
 
371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.43 
 
 
393 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  43.05 
 
 
361 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.87 
 
 
366 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  40.98 
 
 
377 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  40.82 
 
 
368 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.11 
 
 
383 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  39.73 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.07 
 
 
381 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  38.42 
 
 
371 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  38.52 
 
 
367 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  35.12 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  35.81 
 
 
365 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  34.71 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  34.46 
 
 
388 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  34.46 
 
 
388 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  35.26 
 
 
382 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  35.26 
 
 
382 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  35.47 
 
 
377 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  35.51 
 
 
385 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.43 
 
 
361 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  35.26 
 
 
377 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  35.79 
 
 
382 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  35.53 
 
 
404 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  35.53 
 
 
404 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  35.53 
 
 
382 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  35.33 
 
 
368 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  35.07 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  36.28 
 
 
365 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  33.24 
 
 
363 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  30.45 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.87 
 
 
385 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  31.64 
 
 
343 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.11 
 
 
681 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  27.81 
 
 
608 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  24.93 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  26.37 
 
 
357 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  27.27 
 
 
357 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  26.8 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  26.37 
 
 
357 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  24.34 
 
 
357 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  24.34 
 
 
357 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  26.1 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.07 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  26.1 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  25.9 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  26.65 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  26.97 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  26.52 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  24.05 
 
 
357 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  23.78 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.59 
 
 
630 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.01 
 
 
652 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  25.91 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  26.46 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  26.46 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  26.46 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  26.46 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  26.46 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  25.88 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  26.5 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  26.5 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  26.5 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  28.64 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.53 
 
 
1041 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.14 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.14 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  28.11 
 
 
1090 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  22.56 
 
 
1043 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.99 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.3 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.68 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.51 
 
 
1048 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.63 
 
 
1063 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  21.35 
 
 
1147 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.3 
 
 
999 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  26.11 
 
 
912 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.99 
 
 
1082 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  27.16 
 
 
1060 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.63 
 
 
694 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  24.32 
 
 
1084 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.85 
 
 
757 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.63 
 
 
1078 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  24.03 
 
 
942 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.22 
 
 
1044 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.2 
 
 
1032 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  22.91 
 
 
1054 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.1 
 
 
931 aa  52.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  25.08 
 
 
1117 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.44 
 
 
1220 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.95 
 
 
1060 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  27.63 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>