More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2762 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  630  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.75 
 
 
323 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.17 
 
 
323 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.68 
 
 
324 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  55.62 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.31 
 
 
323 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.11 
 
 
336 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 
323 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.24 
 
 
328 aa  338  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.68 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.46 
 
 
340 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  58.44 
 
 
329 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.57 
 
 
323 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.95 
 
 
333 aa  328  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  55.17 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1564  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  55.56 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0141  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  54.14 
 
 
326 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.12 
 
 
340 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.44 
 
 
340 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.47 
 
 
340 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.25 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.46 
 
 
328 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.89 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.52 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  51.74 
 
 
325 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.27 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.45 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1978  putative ABC transporter  52.66 
 
 
321 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4861  putative ABC transporter, permease protein  55.31 
 
 
328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.31 
 
 
327 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.85 
 
 
323 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3081  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.62 
 
 
322 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.957751  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
327 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.69 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.81 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  48.53 
 
 
328 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.63 
 
 
329 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  47.17 
 
 
332 aa  275  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 
325 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
334 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
334 aa  256  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  43.11 
 
 
339 aa  252  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 
312 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.77 
 
 
333 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
306 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  41.25 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.99 
 
 
306 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
328 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  40.65 
 
 
351 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  40.36 
 
 
339 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  39.88 
 
 
336 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
322 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
322 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
322 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  40.06 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
381 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  40 
 
 
337 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.42 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
320 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  40.12 
 
 
336 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
336 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
336 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.12 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
321 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 
336 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
313 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
316 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  235  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
335 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
335 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  38.58 
 
 
339 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  38.58 
 
 
339 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  41.06 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>