More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2519 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  791    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 440 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  37.44 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  38.32 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 419 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 417 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  38.07 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  39.07 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  36.34 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  36.59 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  29.17 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  28.03 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  27.3 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  27.18 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  27.24 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  24.69 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  25.51 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  25.51 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  25.51 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  23.37 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  25.17 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.61 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  25.51 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  25.51 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.1 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  23.1 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  23.1 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  24.58 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  23.1 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  23.4 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  25.09 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  23.08 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  23.1 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>