More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0926 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 270 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  37.61 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.8 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.89 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.7 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  34.48 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.78 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.71 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.12 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.66 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.66 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  35.27 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.27 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.27 
 
 		 315 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.27 
 
 		 315 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  35.27 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.48 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  32.51 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.83 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  29.48 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  31.76 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.46 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.08 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  33.49 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  30.51 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  25.85 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  30.63 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2069  hypothetical protein  37.21 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  31.76 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  28.49 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  31.68 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  26.56 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  31.68 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  32.14 
 
 		 635 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  31.68 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  30.2 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  31.19 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  27.34 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  27.73 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  24.26 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  24.26 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  24.26 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  24.26 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  24.26 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  23.76 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  23.76 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  23.76 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>