More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1076 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
408 aa  833    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
413 aa  480  1e-134  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
413 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 
415 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
415 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
415 aa  398  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
411 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
435 aa  362  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
429 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 
419 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
429 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
429 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
429 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
422 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
424 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
430 aa  335  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
429 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
429 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
423 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
429 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
413 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
419 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
419 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
442 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
429 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  40.24 
 
 
423 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  43.13 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
429 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
422 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
424 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
424 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
424 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
425 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
424 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
428 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
429 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
424 aa  324  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 
415 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
424 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
445 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
426 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
424 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
424 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
442 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
430 aa  323  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
424 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
422 aa  323  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
425 aa  322  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
427 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
424 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
424 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
426 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 
425 aa  319  5e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
416 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
446 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
419 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
426 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
425 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
446 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
433 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
425 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
448 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
424 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
431 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
426 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
447 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
425 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
414 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
446 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
446 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
417 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>