More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4725 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  70.66 
 
 
563 aa  735    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  73.71 
 
 
555 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  100 
 
 
588 aa  1177    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  60.11 
 
 
542 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  60.74 
 
 
541 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 
539 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.97 
 
 
531 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.89 
 
 
542 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  42.62 
 
 
522 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  47.82 
 
 
530 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  44.97 
 
 
539 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  43.92 
 
 
543 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  44.97 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  45.04 
 
 
524 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  45.9 
 
 
542 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.68 
 
 
536 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.1 
 
 
593 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  47.44 
 
 
530 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.49 
 
 
542 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  44.81 
 
 
545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  44.28 
 
 
545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  44.77 
 
 
539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  47.26 
 
 
545 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  43.46 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44 
 
 
525 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  44.02 
 
 
525 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.89 
 
 
543 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  43.54 
 
 
542 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  43.04 
 
 
555 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  46.29 
 
 
533 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  47.16 
 
 
537 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  44.89 
 
 
543 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  44.01 
 
 
565 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  45.95 
 
 
544 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  43.93 
 
 
547 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
536 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  43.82 
 
 
537 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  41.64 
 
 
562 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  43.96 
 
 
552 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.42 
 
 
592 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.8 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 
559 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  46.17 
 
 
571 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  45.66 
 
 
530 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  43.93 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  43.9 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.84 
 
 
593 aa  399  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  41.88 
 
 
603 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
573 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
541 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  43.54 
 
 
527 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 
547 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  44.2 
 
 
552 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  42.99 
 
 
544 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  44.42 
 
 
544 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  46.05 
 
 
552 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  43.8 
 
 
554 aa  398  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.88 
 
 
564 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  47.54 
 
 
539 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  43.56 
 
 
533 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  43.17 
 
 
544 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.11 
 
 
534 aa  399  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  41.3 
 
 
609 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.73 
 
 
533 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  43.17 
 
 
544 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 
548 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.49 
 
 
529 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  39.34 
 
 
530 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.55 
 
 
555 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
536 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  44.17 
 
 
527 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  44.07 
 
 
536 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  40.34 
 
 
597 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.61 
 
 
592 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  43.68 
 
 
568 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.15 
 
 
547 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  44.87 
 
 
541 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.45 
 
 
616 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  42.02 
 
 
553 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.18 
 
 
531 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  42.7 
 
 
533 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
550 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  45.99 
 
 
535 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  42.31 
 
 
546 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  43.84 
 
 
552 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.13 
 
 
537 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 
529 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  45.85 
 
 
542 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 
530 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  40.47 
 
 
619 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  45.56 
 
 
569 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  41.81 
 
 
530 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.8 
 
 
592 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  39.34 
 
 
530 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
601 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  43.36 
 
 
540 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  46.15 
 
 
563 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>