55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2745 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  560  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  69.9 
 
 
291 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.71 
 
 
309 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  69.89 
 
 
280 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  68.86 
 
 
291 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.17 
 
 
294 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  73.17 
 
 
294 aa  345  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  60.07 
 
 
297 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  60.5 
 
 
305 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  30.71 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  28.46 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  27.43 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  24.7 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.41 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.49 
 
 
307 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  22.76 
 
 
296 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  28.74 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  26.51 
 
 
300 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.86 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  30.46 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  27.14 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  24.84 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  24.84 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.84 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  24.84 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.99 
 
 
293 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  21.11 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  21.98 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  27.15 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  26.82 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  25.48 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  22.18 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.39 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  21.18 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28.32 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.34 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.91 
 
 
317 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  28.71 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  24.22 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  24.22 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  24.65 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  24.22 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>