120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1560 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.23 
 
 		 283 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  70.21 
 
 		 280 aa  325  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  70.42 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  63.84 
 
 		 289 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  45.13 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.71 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  43.6 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  44.29 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  44.76 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  47.08 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.42 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  39.36 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  42.2 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  38.81 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  40.57 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  45.25 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  38.95 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  41.2 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  36.59 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  42.19 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.04 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  41.15 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  45.17 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  38.85 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  38.85 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  37.02 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  44.11 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  31.07 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  31.4 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  41.6 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  26.39 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  28.37 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  27.49 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  29.07 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  32.43 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  27.1 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  27.63 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  28.07 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25.44 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  29.77 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  29.39 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  24.38 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  27.24 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  28.84 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  29.63 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  30.03 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  26.85 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.75 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  23.84 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 365 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.23 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.67 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  27.19 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  26.32 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  26.32 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  27.05 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  27.4 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  26.32 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  27.4 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.59 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  32.55 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.47 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  30.3 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  25.93 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  30.19 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.18 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  27.78 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.78 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  28.84 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.57 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.5 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  27.05 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.57 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  35.06 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  28.24 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.19 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  27.41 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  27.08 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.83 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  31.94 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>