237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4947 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  80.48 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  80.48 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  80.08 
 
 		 254 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  77.29 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  74.9 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  72.73 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  70.52 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  70.12 
 
 		 255 aa  355  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  67.19 
 
 		 254 aa  335  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  63.92 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  34.38 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  35.59 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  40.64 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  36.5 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  36.23 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  36.23 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  35.38 
 
 		 293 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  35.74 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.25 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  35.96 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  35.96 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  35.96 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  35.96 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  35.96 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  35.36 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  34.73 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  35.58 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  34.75 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.74 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  34.32 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.72 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  34.36 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  34.36 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  34.93 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  36.75 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  32.67 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  35.31 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.92 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  30.23 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.78 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  29.92 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  31.28 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.19 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  36.63 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  28 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.79 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  33.88 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.23 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  26.62 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  26.62 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  31.46 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.1 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  27.78 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  29.39 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.1 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  29.39 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  27.2 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  24.9 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  28.3 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.43 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  34.45 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  29.23 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  32.95 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.71 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  28.63 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  30.39 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  29.21 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  31.69 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  27.07 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.44 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  29.32 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.24 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  30 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  29.79 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.65 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  25.37 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  25.37 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  28.74 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.36 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  28.35 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  30.51 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.28 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.85 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  28.76 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.74 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  28.34 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  28.41 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>