More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001973 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  100 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  99.35 
 
 		 325 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  92.58 
 
 		 342 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  89.35 
 
 		 325 aa  570  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  83.55 
 
 		 325 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.17 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  62.78 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.08 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00059192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.07 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.35 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.55 
 
 		 325 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.84 
 
 		 324 aa  391  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.04 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.72 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  45.07 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  44.12 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  44.34 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  40.46 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.54 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  38.24 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2538  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.26 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000540331  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2810  peptide ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  39.07 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  38.56 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  38.56 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.11 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.91 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.59 
 
 		 336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  37.3 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  37.78 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.22 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.79 
 
 		 339 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  37.85 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 		 335 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  37.85 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  38.73 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  37.3 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  36.91 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  37.22 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  37.54 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.59 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  37.11 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.48 
 
 		 339 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  37.11 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  36.59 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  37.3 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>