More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001563 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  67.16 
 
 		 480 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  100 
 
 		 486 aa  998    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  82.92 
 
 		 482 aa  830    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  90.23 
 
 		 487 aa  910    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 		 480 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  77.89 
 
 		 484 aa  793    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  86.42 
 
 		 486 aa  883    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  96.3 
 
 		 486 aa  967    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  80.08 
 
 		 491 aa  825    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  62.63 
 
 		 480 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  63.03 
 
 		 482 aa  620  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  60.43 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  54.56 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  54.16 
 
 		 479 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  54.91 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  54.49 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  54.15 
 
 		 477 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 		 482 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  54.78 
 
 		 481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  54.45 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  54.49 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  54.06 
 
 		 477 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  54.58 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 480 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  54.22 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  54.03 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  54.37 
 
 		 475 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  54.22 
 
 		 485 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  56.05 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  54.49 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  52.43 
 
 		 482 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  53.05 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  53.36 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  52.65 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.02 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  54.87 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  55.02 
 
 		 446 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  51.81 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  58.52 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  44.78 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  38.69 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  38.9 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 488 aa  335  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  38.4 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  41.06 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  38.69 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  35.92 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  39.62 
 
 		 483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 482 aa  326  6e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  40.63 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 485 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  37.82 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.21 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  36.97 
 
 		 484 aa  319  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  35.1 
 
 		 478 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  38.4 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 		 497 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 		 503 aa  316  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.31 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.36 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 		 493 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  34.87 
 
 		 496 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.32 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.11 
 
 		 480 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.11 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.75 
 
 		 488 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.1 
 
 		 483 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.32 
 
 		 480 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.32 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  34.85 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.25 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>