More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000975 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  100 
 
 		 342 aa  697    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  81.18 
 
 		 340 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  44 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.25 
 
 		 414 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  35.69 
 
 		 420 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  40.33 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  40.66 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  40.17 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  35.36 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  35.79 
 
 		 449 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  36.15 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  36.15 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  36.15 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  42.65 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  32.33 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  37.81 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  29.11 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.04 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  35.98 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  32.61 
 
 		 726 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1070  histidine kinase internal region  32.33 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.480376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  33.21 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 384 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.68 
 
 		 410 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  31.13 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  33.82 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  33.82 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  33.82 
 
 		 589 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.7 
 
 		 568 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  33.33 
 
 		 589 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  29.96 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  33.33 
 
 		 589 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 645 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 578 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  33.33 
 
 		 522 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 502 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  33.33 
 
 		 589 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  27.66 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35.4 
 
 		 465 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  33.04 
 
 		 610 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 371 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.069158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.38 
 
 		 370 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 584 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  33.16 
 
 		 584 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  26.63 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.49 
 
 		 607 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 		 591 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  32.39 
 
 		 482 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  36.19 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  28.31 
 
 		 392 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.9 
 
 		 568 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  33.77 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.13 
 
 		 589 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1247  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  32.51 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 495 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  35.36 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  32.82 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  31.46 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  36.41 
 
 		 1016 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  33.65 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  31.51 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  33.86 
 
 		 566 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>