More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0482 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0482  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
312 aa  632  1e-180  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.059701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.67 
 
 
333 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  40 
 
 
335 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.52 
 
 
336 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.67 
 
 
333 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
333 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
333 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.39 
 
 
338 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.2 
 
 
340 aa  222  6e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
336 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
336 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
333 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
336 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.68 
 
 
329 aa  221  9e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.03 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.56 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
541 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.26 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.7 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.7 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.47 
 
 
338 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1203  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.51 
 
 
345 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.56 
 
 
370 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.64 
 
 
338 aa  218  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.27 
 
 
339 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  38 
 
 
333 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.94 
 
 
351 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.67 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  36.77 
 
 
341 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.74 
 
 
334 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.07 
 
 
340 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1267  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.54 
 
 
327 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.330108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.86 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.67 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.67 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.02 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.07 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.42 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1112  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.01 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.729195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.27 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.79 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.77 
 
 
320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.87 
 
 
338 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.69 
 
 
366 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.16 
 
 
341 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf389  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.87 
 
 
317 aa  211  2e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.402154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.66 
 
 
344 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.39 
 
 
340 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3908  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.81 
 
 
376 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.98 
 
 
360 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.98 
 
 
360 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.57 
 
 
332 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.72 
 
 
321 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.46 
 
 
334 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.46 
 
 
334 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.62 
 
 
351 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.74 
 
 
337 aa  208  7e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1745  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.81 
 
 
322 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.430959  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.44 
 
 
338 aa  208  8e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.81 
 
 
347 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.02 
 
 
334 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.7 
 
 
342 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.16 
 
 
344 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.66 
 
 
348 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.67 
 
 
355 aa  207  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.77 
 
 
346 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.02 
 
 
341 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.77 
 
 
346 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.16 
 
 
348 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0169  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.44 
 
 
324 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.1 
 
 
345 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.69 
 
 
357 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.02 
 
 
341 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.71 
 
 
338 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.46 
 
 
349 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.09 
 
 
332 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.7 
 
 
371 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.51 
 
 
340 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0404  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.3 
 
 
331 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.41 
 
 
339 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  36.45 
 
 
342 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.15 
 
 
349 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.97 
 
 
352 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.02 
 
 
366 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0922  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.17 
 
 
347 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0472532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18251  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.81 
 
 
352 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.159071  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18041  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.98 
 
 
352 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.83 
 
 
338 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  36.13 
 
 
346 aa  206  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  37.7 
 
 
349 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.29 
 
 
339 aa  205  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.77 
 
 
346 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.66 
 
 
353 aa  204  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.58 
 
 
334 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.57 
 
 
386 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.81 
 
 
352 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.86 
 
 
318 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.21 
 
 
337 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.74 
 
 
344 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  34.52 
 
 
341 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>