63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0167 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  824    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  98.31 
 
 		 415 aa  814    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  55.42 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 438 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 421 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  20.89 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  24.55 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  20.56 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 531 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.19 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.38 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  23.64 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 472 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  35.96 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  25 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  23.36 
 
 		 491 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  24.32 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  31.58 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  31.58 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  31.58 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>