More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1824 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
469 aa  957    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.34 
 
 
455 aa  504  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.46 
 
 
476 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
475 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 
462 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.61 
 
 
484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.76 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.95 
 
 
536 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.24 
 
 
488 aa  302  9e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.09 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 
457 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.76 
 
 
478 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  34.26 
 
 
465 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  33.48 
 
 
466 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.62 
 
 
474 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  34.18 
 
 
460 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
459 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  34.89 
 
 
459 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  33.54 
 
 
469 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  31 
 
 
475 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  32.65 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  32.65 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  32.65 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  32.23 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  33.12 
 
 
468 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 
464 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.14 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.39 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  31.84 
 
 
459 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 
463 aa  213  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
479 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  31 
 
 
469 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
479 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.86 
 
 
458 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  31.45 
 
 
458 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.7 
 
 
467 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.74 
 
 
475 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.97 
 
 
475 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  31.59 
 
 
461 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
467 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  31.7 
 
 
590 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  32.37 
 
 
487 aa  208  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
479 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  30.22 
 
 
458 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  31.7 
 
 
459 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  31.7 
 
 
459 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
478 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 
463 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
465 aa  206  6e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.66 
 
 
468 aa  206  6e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
479 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
467 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  29.93 
 
 
459 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
469 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  31.78 
 
 
713 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.78 
 
 
546 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
467 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
467 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  29.78 
 
 
458 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  30.59 
 
 
459 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 
581 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
467 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  32.33 
 
 
466 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
467 aa  204  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  30.37 
 
 
459 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  30.37 
 
 
459 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  30.46 
 
 
464 aa  203  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.28 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.47 
 
 
712 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  30.99 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  32.18 
 
 
745 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.79 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.27 
 
 
473 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  31.29 
 
 
546 aa  201  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
468 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  31.6 
 
 
716 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  30.26 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 
720 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  30.08 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
584 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
458 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.5 
 
 
473 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  31.29 
 
 
546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.73 
 
 
767 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  33.19 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  31.87 
 
 
716 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.19 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.08 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 
478 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>