More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1403 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1403  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  776    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  33.25 
 
 
400 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  31.58 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  34.14 
 
 
400 aa  171  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  32.06 
 
 
407 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  31.73 
 
 
384 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  28.2 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  29.74 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1012  hypothetical protein  30.17 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.976077  hitchhiker  0.00121188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0080  hypothetical protein  28.75 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.3 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.84 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.76 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.2 
 
 
397 aa  89.7  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.36 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  25.98 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.83 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  39.58 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.83 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.06 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  24.94 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  23.74 
 
 
658 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  27.08 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  39.39 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.6 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  24.28 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  23.61 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.46 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  24.06 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.54 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.69 
 
 
648 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  25.49 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  24.08 
 
 
696 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.28 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  23.39 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  24.53 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.97 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.92 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.47 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.1 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  25.65 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.32 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.44 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  25.18 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  35.81 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.95 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.66 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  37.88 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.18 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.15 
 
 
648 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.15 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  30.34 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.64 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.15 
 
 
648 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.15 
 
 
646 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.15 
 
 
648 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.65 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  38.73 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.15 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.79 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.38 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.27 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  33.57 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.17 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  22.66 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  31.49 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  26.83 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 
437 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  31.65 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  31.65 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  31.65 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>