More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0425 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
112 aa  223  5.0000000000000005e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  41.67 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  41.58 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  40.4 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  38.89 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  39.29 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  32.53 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  39.56 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  38.54 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  37.04 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  37.25 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  37.23 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  34.26 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  42.22 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  47.37 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  43.24 
 
 
282 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  43.24 
 
 
301 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  32.18 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  41.77 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  36.26 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  41.25 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  43.24 
 
 
918 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  43.24 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  43.24 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  43.84 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  33 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  36.14 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  34.78 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  43.42 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  37.21 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  41.77 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  34.88 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  35.96 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  36.99 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  36.36 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.8 
 
 
290 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  37.11 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  35.23 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  43.84 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  39.76 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.8 
 
 
290 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.71 
 
 
290 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  35.71 
 
 
290 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  43.84 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  36.26 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.24 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  43.24 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.5 
 
 
280 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  38.55 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  38.36 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  41.1 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
289 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  32.65 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  37.23 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  39.74 
 
 
310 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  40.51 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  38.36 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  33.68 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  39.24 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  40 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  36.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  39.73 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  39.24 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 
610 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  33.33 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  36.99 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  41.89 
 
 
282 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  41.89 
 
 
282 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  41.89 
 
 
282 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  41.49 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  27.27 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.8 
 
 
290 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  36.99 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  35.63 
 
 
289 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35.63 
 
 
290 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  40 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  37.89 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  36.99 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  38.36 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.5 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  40.26 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  35.63 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  31.4 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  45.21 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  33.78 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  38.2 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  38.2 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  44.59 
 
 
282 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  37.8 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  36.26 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  42.5 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  38.46 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  38.75 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  43.24 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  41.67 
 
 
406 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  39.53 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>