223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4219 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  58.5 
 
 		 202 aa  247  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  58.59 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  61.05 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  61.05 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  61.05 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  58.42 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  58.42 
 
 		 204 aa  240  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  57.67 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  55.14 
 
 		 198 aa  207  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  51.63 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  44.51 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  44.22 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  41.8 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  42.47 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  44.39 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  45.21 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  43.46 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  40.54 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  41.8 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  40.11 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  40.43 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  39.25 
 
 		 192 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.5 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  40.59 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  31.63 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  30.57 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  35.45 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  30.27 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  29.57 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  30.11 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  28.65 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  29.35 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.02 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30.69 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  28.33 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  29.57 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  31.58 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  29.35 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  31.46 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.46 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  30.11 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  29.66 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  27.89 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  30.29 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  29.94 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  29.28 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  29.07 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  28.9 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  26.14 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  28.11 
 
 		 190 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  26.84 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  27.44 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  26.84 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  28.42 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  27.75 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  28.32 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  25.26 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  29.21 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  26.32 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  29.21 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  27.04 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  32.5 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  28.26 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  28.26 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  26.59 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  24.35 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  31.79 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  27.78 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  26.86 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  26.86 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  28.25 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  28.92 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  28.32 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  28 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  26.86 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  26.86 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  28 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  25.67 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  29.45 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  26.86 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>