More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0869 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  72.3 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  73.65 
 
 		 147 aa  227  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  70.27 
 
 		 147 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  70.27 
 
 		 147 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  70.27 
 
 		 147 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 147 aa  219  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  65.54 
 
 		 147 aa  204  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 147 aa  204  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  65.54 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  65.54 
 
 		 149 aa  203  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 147 aa  203  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 147 aa  203  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 147 aa  202  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  66.22 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  63.51 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 147 aa  199  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  65.54 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  65.54 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  66.67 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  66.22 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  60.81 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  61.49 
 
 		 147 aa  190  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  61.49 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  63.51 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  62.16 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  62.84 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 154 aa  176  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  57.97 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.11 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  57.43 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  56.08 
 
 		 149 aa  171  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  53.42 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 161 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 176 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>