More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1169 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
206 aa  418  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  94.09 
 
 
210 aa  391  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  53.24 
 
 
219 aa  230  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.93 
 
 
231 aa  230  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.17 
 
 
217 aa  188  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  43.64 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  44.86 
 
 
299 aa  171  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.65 
 
 
299 aa  171  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.49 
 
 
253 aa  168  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.93 
 
 
228 aa  168  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.78 
 
 
276 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.02 
 
 
226 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.25 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.75 
 
 
251 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.34 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.12 
 
 
230 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.23 
 
 
217 aa  164  9e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.43 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.94 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.45 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.58 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.67 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.39 
 
 
233 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.48 
 
 
312 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.11 
 
 
240 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 
228 aa  157  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.62 
 
 
281 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  44 
 
 
266 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.19 
 
 
236 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.16 
 
 
244 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.42 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  40.18 
 
 
224 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.27 
 
 
262 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.86 
 
 
261 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.92 
 
 
284 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  40.89 
 
 
266 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.24 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.35 
 
 
282 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.91 
 
 
273 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.91 
 
 
273 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.91 
 
 
273 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.37 
 
 
294 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.93 
 
 
284 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.1 
 
 
212 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.5 
 
 
220 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.83 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.5 
 
 
232 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.88 
 
 
215 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.45 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  39.7 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.92 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  40.93 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.16 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.29 
 
 
214 aa  131  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.9 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.95 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.9 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.21 
 
 
226 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.61 
 
 
211 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39 
 
 
215 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.06 
 
 
225 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.88 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.34 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  38.58 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.94 
 
 
214 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.93 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.93 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.72 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.69 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.41 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.5 
 
 
216 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  32.84 
 
 
228 aa  104  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.86 
 
 
220 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.47 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.5 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.24 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.04 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.47 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.47 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.49 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.95 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.98 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.54 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  29.63 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.16 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.16 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.89 
 
 
308 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.54 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  29.89 
 
 
308 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.04 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.86 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.86 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.73 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.97 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  34.46 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  30.73 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  34.46 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4460  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.13 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>