More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0360 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0262  small GTP-binding protein  94.15 
 
 
570 aa  998    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0360  small GTP-binding protein  100 
 
 
568 aa  1108    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.700124  normal  0.27234 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0483  small GTP-binding protein  51.39 
 
 
580 aa  504  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.742862 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1325  small GTP-binding protein  50.44 
 
 
571 aa  485  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.936216 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  25.21 
 
 
587 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  25.21 
 
 
587 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  29.15 
 
 
626 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  27.1 
 
 
665 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  26.39 
 
 
606 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  27.73 
 
 
626 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  29.41 
 
 
620 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  26.97 
 
 
618 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  26.21 
 
 
662 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  29.19 
 
 
621 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  27.34 
 
 
637 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  29.39 
 
 
683 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  26.2 
 
 
637 aa  147  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  27.33 
 
 
626 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  29.94 
 
 
615 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 
647 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  27.84 
 
 
617 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  26.93 
 
 
597 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  26.82 
 
 
626 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  28.18 
 
 
621 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  27.43 
 
 
621 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  26.22 
 
 
625 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 
621 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  27.45 
 
 
626 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  27.56 
 
 
633 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  28.01 
 
 
617 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  27.26 
 
 
621 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  27.26 
 
 
621 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  27.67 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  26.47 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 
631 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  27.88 
 
 
618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  27.81 
 
 
617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  27.48 
 
 
647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  27.05 
 
 
632 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  29.82 
 
 
676 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  28.78 
 
 
666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 
669 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  25.6 
 
 
631 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 
667 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  28.55 
 
 
610 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  25.74 
 
 
648 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  27.37 
 
 
697 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  28.24 
 
 
576 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 
662 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 
662 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  26.86 
 
 
617 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  26.53 
 
 
662 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 
662 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 
662 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.1 
 
 
662 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  24.95 
 
 
693 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  30.16 
 
 
665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.01 
 
 
662 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  26.64 
 
 
662 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  27.74 
 
 
576 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 
662 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  29.89 
 
 
668 aa  120  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  28.9 
 
 
784 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 
680 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  24.33 
 
 
665 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  29.57 
 
 
662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  27.35 
 
 
576 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  27.08 
 
 
674 aa  117  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  29.82 
 
 
848 aa  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  29.97 
 
 
785 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.8 
 
 
571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  30.66 
 
 
680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  27.66 
 
 
684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  29.63 
 
 
688 aa  115  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  24.2 
 
 
724 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  27.67 
 
 
619 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  25.2 
 
 
664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1569  ferrous iron transport protein B  25.97 
 
 
659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000694144  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 
646 aa  110  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  26.43 
 
 
628 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  25.77 
 
 
700 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  29 
 
 
666 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  24.67 
 
 
650 aa  108  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  30.94 
 
 
774 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  27.86 
 
 
595 aa  107  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  25.79 
 
 
664 aa  106  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  28.07 
 
 
669 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  25.79 
 
 
664 aa  106  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  27 
 
 
669 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  29.43 
 
 
783 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  30.3 
 
 
774 aa  104  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0599  ferrous iron transport protein B  29.46 
 
 
640 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0621968  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  27.49 
 
 
669 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  31.46 
 
 
816 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  29.15 
 
 
751 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 
786 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  28 
 
 
676 aa  101  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.85 
 
 
665 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>